故事从主人公漩涡鸣人的孤儿生活开始，他的父母为了保护村子，将攻击村子九尾妖狐封印到了他体内，鸣人因此受尽了村人的冷落，只是拼命用各种恶作剧试图吸引大家的注意力。好在还是有依鲁卡老师的关心，鸣人的性格才没有变得扭曲，他总是干劲十足、非常乐观。 为了让更多的人认可自己，鸣人的目标是成为火影。整个故事就围绕鸣人的奋斗、成长，鸣人的同伴们的故事，以及这个忍者世界的各种争斗和阴谋展开。
某日，由于父亲再婚而多了“姐姐”的水原朋也（13岁）面前出现了超级弟控水原一香（17岁）！ 作为弟控的水原一香身边还有形形色色的同学们，最高最强的抖S琉璃，爆乳宅女麻里奈！于是水原朋也一边觉得姐姐的爱好沉重一边与“姐姐们”展开了丰富多彩的生活喜剧！
