故事从主人公漩涡鸣人的孤儿生活开始，他的父母为了保护村子，将攻击村子九尾妖狐封印到了他体内，鸣人因此受尽了村人的冷落，只是拼命用各种恶作剧试图吸引大家的注意力。好在还是有依鲁卡老师的关心，鸣人的性格才没有变得扭曲，他总是干劲十足、非常乐观。 为了让更多的人认可自己，鸣人的目标是成为火影。整个故事就围绕鸣人的奋斗、成长，鸣人的同伴们的故事，以及这个忍者世界的各种争斗和阴谋展开。
在水族馆工作的18岁女高中生·海咲野空琉，与在东京失去了自己的位置、因而逃走的前偶像宫泽风花相遇了。空琉和风花将各自的想法埋藏于心、在水族馆中度过了一段时光。但是，在那个重要的地方，闭馆的危机正在迫近。少女们的梦想与现实，孤独与朋友，羁绊与纠结——将会在这个夏天展开闪耀的新篇章。
