故事从主人公漩涡鸣人的孤儿生活开始，他的父母为了保护村子，将攻击村子九尾妖狐封印到了他体内，鸣人因此受尽了村人的冷落，只是拼命用各种恶作剧试图吸引大家的注意力。好在还是有依鲁卡老师的关心，鸣人的性格才没有变得扭曲，他总是干劲十足、非常乐观。 为了让更多的人认可自己，鸣人的目标是成为火影。整个故事就围绕鸣人的奋斗、成长，鸣人的同伴们的故事，以及这个忍者世界的各种争斗和阴谋展开。
女大学生津场木葵拥有从过世的祖父那里继承来的、能看见妖怪的能力。她突然被抓到了妖怪栖息的隐世的老字号旅馆“天神屋”。感到困惑的葵得知了祖父留下的庞大欠款，以及她作为抵押必须嫁给鬼神大老板这一约定。无法接受的葵为了反抗婚事、起死回生，而向妖怪们宣言她会在天神屋工作来偿还欠款……
时值19世纪，在英国名门贵族凡多姆海伍家，有一位神秘、优雅、十全十美的执事，他就是“黑执事” 塞巴斯蒂安。虽然塞巴斯蒂安总是淡淡地说： “我只是一名执事罢了”，但举止、知识、品味、料理、武术等等没有任...
更达（石田彰 配音）和更纱（木村亚西子 配音）是一对孪生兄妹，在出生的那一刻，更达即被冠上了“命运之子”之名，成为了整个国度的希望，希望他能够推翻昏庸的君主建立新的国度。一次意外中，更达和更纱遭遇了赤王朱里（井上和彦 配音）的军队，所幸被扬羽（盐泽兼人 配音）所救。数年后，赤王的军队以造反罪处死了更达，为了复仇，悲愤的更纱女扮男装扮作更达带领村民们逃离故土。 传说中，只要寻得四把宝刀，即可获得强大的力量，心中充满仇恨的更纱踏上了寻刀之旅。可是天意弄人，在途中，她与朱里相遇了。不是以赤王和更达的身份，作为一个普通女子和一个寻常男子，不知情的两人相爱了。背负着沉重宿命的两人在得知真相后皆痛不欲生，但是责任与道义使得二人不得不兵戎相向。最终，更纱决定放弃更达的身份，放弃憎恨和复仇，她原谅了朱里，可是一直支持她的众人却不能原谅她。
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
