一次意外中，桃宫草莓（中岛沙树 配音）的DNA中混入了山猫的DNA，之后，一系列奇怪的变化发生在了她的身体上，她的行为举止越来越像一只猫咪，并且，在草莓的周围，开始出现了一些形状可怖的袭击者。喵喵咖啡馆的店长赤坂圭一郎（绿川光 配音）找到草莓，他告诉他，世界的和平正在受到威胁，只有一种名叫喵喵水晶石的宝物才能阻止恶势力的扩张，他希望草莓能够利用自己的超能力来寻找这些水晶石。 与此同时，大小姐蓝泽薄荷（嘉数由美 配音）、温柔的碧川莴苣（佐久间红美 配音）、可爱的黄步玲（望月久代 配音）和漂亮的藤原石榴（野田顺子 配音）先后出现在了草莓的面前，她们都是拥有喵喵力量的少女，此刻，她们集结在一起，将要面对的，是实力十分强大的蓝影者（绪方惠美 配音）。
在历史悠久，文化底蕴深厚的故宫之中，住着很多可爱的猫猫，在人类看来，它们过着令人艳羡的悠闲生活。其中有六只御猫与众不同，它们肩负着保护文物记忆——“物华”的重任。它们进入物华的世界，一次次战胜破坏者黑枭，让物华世界重新回归到正确的轨道上，从而守护文物。这六只御猫分别是文班的鲁班、么么，和武班的霜眉、鳌拜、平安、小仔，它们智勇双全、默契无间，组成了守护国宝物华世界的——紫禁御喵房。
在德川幕府末期的动荡时期，有一个被人称为“人类斩刀”的士师。 随着新时代的到来，这个人从人民面前消失了，成为了一个被称为“最强者”的传奇人物。时光荏苒——明治11年的东京市中心。 将倒剑放到腰间并发誓不朽的旅行剑客日村剑心遇到了神谷胜心流的大师神谷薰。 剑心在解决了欺骗胜心流的辻砍“冢斋人”的案件后来到薰身边。 他遇到了来自东京都石狮部落的明神弥彦和自称是格斗家的相乐赛之助等朋友，并面对由于他过去的关系而将战斗的克星。 新时代辛勤生活的人们的明治剑客串浪漫在这里开启！
