故事以一連串女高中生離奇死亡的事件開始，深陽學園2年C組的女學生宮下藤花原來隱藏著「Boogiepop Phantom」的第二重人格，行為奇異，究竟宮下是否這些死亡事件的主谋？ 「Boogiepop Phantom」到底是都市中傳說的死神，還是正義的使者？
拓展出无限可能性的虚拟现实大型多人在线角色扮演游戏《方舟地球网络版》。玩家建立的国度阿尔凯特王国拥有九位贤者，其中有一位威风凛凛的老年召唤术士名叫邓不利夫，是游戏玩家之一。某一天，他感受到世界发生了异常的变化。不仅产生了游戏中本没有的味觉和嗅觉，更是无法退出游戏。甚至在非玩家角色身上发现了酷似人类的反应。这证明了游戏已经成为了不折不扣的现实。而且这个世界已经走过了足足30年。更不可思议的是，邓不利夫因为种种原因身体变成了幼小而美丽的少女！为了解开面目全非的世界之谜，邓不利夫自称为贤者的弟子米菈踏上了旅途。在冒险的最后等待他的会是什么呢——。
