吉冈双叶从国中时期就很不擅长和男生相处，却有一位名为“田中”的男生例外，然而田中在暑假转学了，双叶也来不及传达自己的心意。之后，在男生群非常受欢迎的双叶遭受女生的排挤，在升上高中后的双叶为了不再让女生讨厌决定要伪装自己，同时她与国中时代的初恋“田中”再次相遇了……
爱德华德和他的弟弟阿尔芬斯十分思念在他们还小的时候亡故的母亲，实行了炼金术中最大的禁忌——可以将死者复活的人体炼成。 可是炼成失败，爱德华德失去了左腿，阿尔芬斯则失去了全身。爱德华德好不容易才以牺牲自己的右臂为代价将弟弟的灵魂炼成，并定着在一副铠甲上，可是其代价未免太大了。爱德华德和阿尔芬斯一起，为了找回所失去的一切，开始踏上了寻找拥有极大力量的“贤者之石”的旅程。 右臂和左腿用钢制义肢“机械铠”来替代的他，被人们称为“钢之炼金术师”…
