即将升上初中二年级的朝日奈未来，在春假的某天晚上，看到一神秘物体从天落入附近的公园里。“难道是魔法使？”，兴奋的未来第二天一早就和自小就喜爱着的绒毛玩具熊“毛芙伦”一起向公园前进。结果在那里看到的是……骑着扫帚漂浮在空中的女孩……自称是理子的那个女孩子，竟然是魔法使。 未来对魔法使非常感兴趣，对理子问东问西的。理子好像是为寻找“某物”而来到未来居住的世界。此外，仔细一看，她们两人带着同样的吊坠…。 就在此时，暗之魔法使•多库罗克希的部下巴提在两人面前出现。他逼迫理子交出“波纹翡翠”（リンクルストーン・エメラルド，Wrinkle Stone Emerald），但是理子好像也在寻找“波纹翡翠”…… 当被巴提的黑暗魔法所诞生的怪物欲望怪逼入绝境时……未来和理子、还有毛芙伦手牵着手，不断地喊出魔法的咒文“Cure Up・Rapapa! ”，吊坠突然发出了光辉。 于是，传说的魔法使“光之美少女”就此诞生。
五十岚双叶，是入职丝卷商社刚到第二年，想要尽快独当一面的新人。武田晴海，则是个性有些粗犷，但很会照顾人的前辈。双叶虽然觉得武田前辈比较烦人，但有时也会觉得温馨，后来还是觉得很烦人……就这样摇摆不定。
作为网络吉他手“吉他英雄”而广受好评的后藤一里，在现实中却是个什么都不会的沟通障碍者。一里有着组建乐队的梦想，但因为不敢向人主动搭话而一直没有成功，直到一天在公园中被伊地知虹夏发现并邀请进入缺少吉他手的“结束乐队”。可是，完全没有和他人合作经历的一里，在人前完全发挥不出原本的实力。为了努力克服沟通障碍，一里与“结束乐队”的成员们一同开始努力……
