在埃及与宿敌DIO的死斗之后过了11年。1999年，空条承太郎为了与祖父乔瑟夫·乔斯达的私生子东方仗助见面，而来到了日本M县S市杜王町。但，仗助却持有与承太郎相同的特殊能力“替身”。之后，以承太郎的来访为开端，仿佛被吸引一般，新的“替身使”们开始行动。“这座城镇存在着什么……”为了守护养育了自己的杜王町，仗助挺身而出——。
故事以一連串女高中生離奇死亡的事件開始，深陽學園2年C組的女學生宮下藤花原來隱藏著「Boogiepop Phantom」的第二重人格，行為奇異，究竟宮下是否這些死亡事件的主谋？ 「Boogiepop Phantom」到底是都市中傳說的死神，還是正義的使者？
光子力研究所は都心（練馬区大泉学園光子力町）にあり、地下帝国（群馬あたり）のあしゅら男爵は“世界征服”のために機械獣少女を派遣し、研究所自体や町内に迷惑をかけに来る。光子力研究所にはZちゃん（マジンガーZ娘）、グレちゃん（グレートマジンガー娘）、グレンダさん（グレンダイザー娘）の3人が暮らしており、皆、普段から鋼鉄の魂スーツをまとっている。一応は普通の人間、夢見る少女であるらしい。（が、腕を飛ばしたりするので定かではない）かたや機械獣少女たちも怪しげな着ぐるみをまとってはいるが、とりあえず普通の少女たちであるらしい。（が、首を飛ばされても死なない奴もいるのでやはり定かではない）地下帝国の野望は“世界征服”だが、食い逃げをしたりレジャースポットを占拠したり、その行動はいつも「小さな迷惑」の域を出ない。
传说中的部队——创形者队拯救了EL潜行者的第2次志愿者联盟战已经过去两年。 曾经的战场——高达模型联网对战（GBN）在经过版本升级后，加入了感觉反馈功能，代入感也得到进一步提升。不过也有很多潜行者并非出于跟风，而是怀揣各自想法进入这一世界。 悠人是个扮演着佣兵，独自徘徊于次元世界空间的潜行者。 风见孤傲轻佻，梦想受众人崇拜，穿梭在不同团队。 芽依从早到晚进行高达模型对战，是个浑身散发神秘气息的独行侠。 孤独的新人帕维兹对合作玩法深感兴趣，却因为内向至今未能得偿所愿。 这些原本孤独的玩家，却因为某个契机，组成另一支「创形者」了。等待着悠人他们的，是超越GBN的无极限超体验。
