由于不堪忍受老师和妈妈的责骂，大雄决定实施第n次出走计划。与此同时，胖虎、小夫、静香也因为各种各样的原离家出走。小伙伴们凑在一起，但拥挤狭窄的现代都市没有他们的立锥之地。在哆啦A梦的帮助下，他们乘坐时光机来到7万年前的日本。当时这片土地上渺无人烟，绿草晴空，空气清新。小伙伴们展开想象，营造属于自己的快乐家园。 偶然间，他们遇到从远古穿越时空来到现代的中国少年克克鲁。克克鲁生在爱好和平的光明族，他们这一族被凶恶残暴的黑暗族袭击，克克鲁则恰巧碰到时空乱流来到现代。大雄他们将克克鲁带到7万年前的日本，小伙伴们同情这个男孩的遭遇，决定帮助他打败黑暗族，拯救族人……
出生在偏远村落的希尔·菲尼克斯为了完成对母亲临终前的承诺，带上家族遗物龙骨水晶踏上了去往失落的国度寻找身世的旅程。来到蛇骨之国的希尔，误入了四大家之一的赤骨家大宅，被蛇骨之国通缉，与赤骨家继承人光子经历一连串的事件后，从敌对成为朋友，揭开了埋藏在赤骨家几十年的秘密，四大家及魔法部进行人体实验制造出“人造天赋者”来解决家族天赋者血统日渐稀薄的问题，从而巩固人类及四大家族在大陆的统治地位。希尔觉醒了自己领悟到魔法的真谛，像曾经的五大“贤者”一般，打破魔法的宿命，彻底消灭了灭世黑龙，同时断绝世界上所有的魔法，还全大陆生灵一个真正和平的世界。
