中世纪的中国和日本，被各个国家分而治之。天空中，由八艘船组成的城船武藏正在航行……在遥远的未来。经历了“合、合、乱”的国家，实行了与人类命运相关的“圣谱”作为原始历史的再现。然后就是各种各样的人，把迷茫和决心藏在胸口，锐意进取，开拓未来。以重叠的中世纪世界为舞台，学园里的各国学生斗争正式上演！
建造于这个世界的某一角的超巨大综合动物园「加帕里公园」。 在那里有着动物们会变成人的模样的不可思议的现象……。 不知何时渐渐地被称呼为“朋友”的动物们，就这样在公园里和平地生活着。 某一天，动物朋友的薮猫与狞猫，在森林之中遇到了人类的孩子。 肚皮空空的人的孩子似乎烦恼着什么，于是薮猫们决定一众一起开始旅行、去解决ta的烦恼。 在旅行的途中所遇到的是个性迥异的动物朋友们、公园的秘密与美食！ 以及还有撼动大地程度的大危机！？ 全新的加帕里公园的故事，就此开始！！
