僕は、思い出せずにいる。自分が一体、何なのか――。魔法学校の生徒セービルは、入学以前の記憶がない。自分がなぜここにいるかもわからないまま過ごす学校生活はどこか空虚で、努力の方法も分からないまま、成績は常に最下位だ。そんなセービルに、魔法学校の学長・アルバスは、突如危険な特別実習を言い渡す。「魔女狩りのある地域で、魔法の有用性を広めてほしい」魔女と教会の戦争が終結して数年――世界はまだ、魔女と魔法を完全に受け入れてはいなかった。時は魔法使い黎明期。これは、何者でもない少年が、心に傷を隠した仲間たちと、自分を見つける物語。
出生在偏远村落的希尔·菲尼克斯为了完成对母亲临终前的承诺,带上家族遗物龙骨水晶踏上了去往失落的国度寻找身世的旅程。来到蛇骨之国的希尔,误入了四大家之一的赤骨家大宅,被蛇骨之国通缉,与赤骨家继承人光子经历一连串的事件后,从敌对成为朋友,揭开了埋藏在赤骨家几十年的秘密,四大家及魔法部进行人体实验制造出“人造天赋者”来解决家族天赋者血统日渐稀薄的问题,从而巩固人类及四大家族在大陆的统治地位。希尔觉醒了自己领悟到魔法的真谛,像曾经的五大“贤者”一般,打破魔法的宿命,彻底消灭了灭世黑龙,同时断绝世界上所有的魔法,还全大陆生灵一个真正和平的世界。