某天，班上转来了两个学生，一个是跳级生美滨千代，她拥有着和可爱外表完全不匹配的天才级智商，以及同智商完全不匹配的情商。另一个叫春日步，她倒是表里如一的迟钝和呆萌。很快，她们便和同学们打成了一片。泷野智人称阿智，争强好斗的同时，却有着意外的单纯和天真。外表冷静成熟的榊对世上一切可爱的东西抵抗力为零。水原历是阿智的童年玩伴，成绩优秀的她毫无疑问的成为了阿智的挑战对象。再加上一个活宝班主任谷崎由佳里，这群人聚到一起，想必这三年的高中生活一定会多姿多彩的。
曾从日本来访，给世界带来巨大灾害的“迷途之人”。因为他们过去带来了毁灭世界的灾难，所以被视为“禁忌指定”，有必要暗中处刑。以处刑“迷途之人”为业的“处刑人”梅诺，有一天遇到了日本少女灯里。梅诺像往常一样打算完成任务，但因为灯里的“某种能力”而以失败告终。为了确实地处刑灯里，梅诺带着她，向着能够消灭任何异世界人的仪式场地的大教堂进发。看着对这场自己即将被杀的旅行一无所知，而单纯地享受着的灯里的样子，梅诺心中有什么地方开始改变了。——这是，她为了杀她的故事。
