天才少年古云，因为被上古神族中下神印，导致灵力减弱，成为青山门公认的废物，被贬为杂役。父亲因此被牵连，废除族长之位，囚禁在敌人飞卢家族的天牢里。这时古云发现了自己身上隐藏的秘密，并且跟古神达成合作协议。
职于新宿区政府的宫古新，本应成为一个普通的公务员，却被调遣到了一个东京23区各区都无人知晓的“夜间地区交流科”工作。 工作的内容是，解决各种妖怪们引起的超自然事件。 与部门的前辈即课长榊京一，和狂热爱好超自然现象的姬冢圣央一起，每日与超越人类常识的存在相处，日日夜夜出勤工作。
哈库梅伊和蜜珂析。两个小女孩住在充满绿色的森林里。在树洞里建造家、把树叶当做伞、坐在昆虫或鸟的背上…如果你身高9 cm，这种事情是可以做的。你不想偷偷看一眼吗？他们的生活平静而幸福，非常可爱。
