故事发生在未来纪元，地球经历了未知变故，地貌环境大变。新纪元人类为了克服恶劣的生存环境，恢复地球生态，依赖和使用大型机械载具和变形机甲。边陲小镇少年林一，从小与父亲生活在一起。父亲因神秘事件外出未归，林一踏上了寻找父亲的旅途。积极探寻生命续的意义和善的美好。随着地球变故的真相“人工智能之乱”浮出水面，同时面对不同智慧文明的碰撞，男孩与伙伴将该如何坚守善的本心为新纪元带来光明和希望。
建造于这个世界的某一角的超巨大综合动物园「加帕里公园」。 在那里有着动物们会变成人的模样的不可思议的现象……。 不知何时渐渐地被称呼为“朋友”的动物们，就这样在公园里和平地生活着。 某一天，动物朋友的薮猫与狞猫，在森林之中遇到了人类的孩子。 肚皮空空的人的孩子似乎烦恼着什么，于是薮猫们决定一众一起开始旅行、去解决ta的烦恼。 在旅行的途中所遇到的是个性迥异的动物朋友们、公园的秘密与美食！ 以及还有撼动大地程度的大危机！？ 全新的加帕里公园的故事，就此开始！！
一位名为才贺胜的小学5年级学生，在父亲因事故去世后继承了庞大的遗产，生命也因此受到了威胁。就在此时，一位名为加藤鸣海的青年偶然与胜相遇，并决定向他伸出援手。 然而，追杀胜的并非人类，而是具备高超战斗能力的傀儡使们。就在两人陷入绝境的时候，一位操纵着悬丝傀儡的银发少女·白银突然出现，拯救了他们。 就这样，在日本相识的这三人开始被卷入多舛的命运齿轮当中——
