世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击，现在启动！
作為社畜每日辛勤工作的男人，桐尾禮治。今天也頂著死魚眼朝公司走去，不知不覺中身處在異世界的森林之中。…啊，是最近流行的異世界轉生啊。擁有的技能是「鑒定、製藥」這兩個，就這…？算了。雖然是這麼想的，但是這兩個技能似乎是超乎想像的開掛技能！不斷地創造出這個世界裡不存在的回復藥等等，轉眼間就大賺一筆。絕對不可能再作為社畜工作了！下定決心要過上悠閒生活，開了一家藥店。以異世界的藥店為舞臺，悠閒生活的故事即將開始。
