位于东京御台场，拥有自由校风和多项专科的人气高中「虹咲学园」。对学园偶像的魅力感到心动的普通科2年级高咲侑，和儿时玩伴上原步梦一起敲响了「学园偶像同好会」的门。 有时作为对手，有时作为同伴，胸怀各自的心意，每天展开活动的成员们。「如果能够为追逐梦想的人加油的话……。」12名与1名少女所编织的，第一次的「大家实现梦想的故事（School Idol Project）」。响彻吧！我们的心动——现在，再一次追逐梦想吧！
每个人都有着不让任何人所看见的一面——这是一个世界各国在暗地里展开激烈情报战的时代。东国和西国已经处于冷战状态长达十余年之久。隶属于西国情报局对东科（WISE）的精英间谍“黄昏”，为了调查东国国家统一党总裁多诺万·德斯蒙这一威胁东西和平的危险人物的战争计划，黄昏被指派了一个绝密的任务。这个任务称之为“枭”作战。任务的内容是在一周内组建成一个家庭，潜入德斯蒙的儿子就读的名校，并解决掉德斯蒙。但是，黄昏所遇到的“女儿”是能读懂内心的超能力者，“妻子”则是暗杀者。三人为了彼此的利益而成为了一家人，并决定在隐藏真实身份的情况下共同生活。世界的和平被托付给了这个意外频出的临时家庭。
