克劳斯在成功抓获《尸》的同伙后返回阳炎宫。 然而，在那里得知的却是缇雅、莫妮卡、安妮特和爱尔娜选拔组的失踪。 选拔组的女孩们在度假时遇见了一位因失忆而来历不明的女孩——安妮特的母亲。 每个人都对重聚感到兴奋，但这却是分裂团队残酷命运的开始。 失踪少女的《秘密的任务》到底是什么？ 世界最强的间谍们、世界最大的欺骗！
ヴァンガードで運命大戦に勝利し、妹ヒカリの健康を叶えた明導アキナ。 運命者カードの所有者たちを招集したガブエリウスは、運命大戦の真の目的を明かす。 そして現れるもう一体のぬいぐるみ、シヴィルト。 6人の宿命者カードの所有者を引き連れたシヴィルトは、 勝利した者たちが願いを叶えられるという「宿命決戦」の開幕を宣言する。 運命vs宿命、因縁と思惑が交差する激しい戦いが始まった！
在埃及与宿敌DIO的死斗之后过了11年。1999年，空条承太郎为了与祖父乔瑟夫·乔斯达的私生子东方仗助见面，而来到了日本M县S市杜王町。但，仗助却持有与承太郎相同的特殊能力“替身”。之后，以承太郎的来访为开端，仿佛被吸引一般，新的“替身使”们开始行动。“这座城镇存在着什么……”为了守护养育了自己的杜王町，仗助挺身而出——。
