在世界局势相对稳定的20世纪，各主要国家都想加强军事力量，称霸世界。而耳语者【whisperd】，一个特殊的人类，从出生起就有特殊的能力，不用学习就能知道超越当时科技几十年的被称为黑科技的高科技手段。为了保护世界格局的稳定，神秘组织秘银[ Myslil]派出上士项梁等三人保护一个已知的耳语者[Whisper]，即千鸟香奈。其中上士向亮假扮转校生随时跟随保护。因为长期在部队生活，没有普通高中生常识的上士向亮在学校闹出不少笑话。上学期间发生了很多恐怖的事情，比如苏联制造的劫持金奈事件。宗和千鸟也因为各种事件产生了特殊的感情。
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石头世界里，千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”，最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是，由灵长类最强的高中生狮子王司领导的“武装帝国”却步步为营。旨在净化人类的司试图通过使用强大的力量来阻止科学的发展。 科学 vs 武力的战斗经过激战，千空等人的科学王国占优势，之后两国终于和解。 由于同伴的谋反而处于冷休眠状态的司为了复活全人类，科学王国以石化光线的发生源、地球的背面·新世界作为目标！ 冲出世界解开石化之谜！石头世界大航海时代终于开幕——‼
不敌病魔而辞世的青年——火乐，被神明复活并变年轻后转移到异世界，期待展开享受悠闲农业的第二人生！ 得到神明所授予的「万能农具」，火乐得以自由自在地在异世界拓荒耕种。过程中，不只是天使及吸血鬼，就连精灵与龙也接踵现身……转瞬间便发展成村落规模，回过神来，自己已成了村长!?慢活生活&农业奇幻谭，在此揭幕！
老牌网络游戏“幻境神话”引入第十二次资料片改版〈开拓智域〉后，日本有三万名用户被锁在游戏当中。现实与游戏奇妙融合的世界中，男主角城惠在秋叶原街的舞台上展开了战斗。
