在一次邂逅中得到死神的力量而成为“代理死神”的黑崎一护， 被卷入死在现世的魂魄所聚集的地方——尸魂界的动乱中，在激烈的战斗中 和同伴一起也成长了很多。 因为一护的生活，所生活的空座町发生了异变。 新的死神和新的敌人的出现，以及呼救声。 一护再次拿起斩魄刀，踏上战场。 另一方面，在尸魂界观测到现世中的虚突然连续消失 被引导到这片土地的灵魂所生活的流魂街居民们发生了失踪 并且死神们驻守的灵屋・瀞灵廷被贼军袭击。 贼军的真实身份是灭却师始祖・友哈巴赫所率领的“无形帝国”。 “无形帝国”向死神们宣战。 5天后，尸魂界被“无形帝国”歼灭 历经千年之久死神们所背负的因缘。 那个宿命和隐藏的真相终于被揭开。 一切都走向终结。 黑崎一护，最后的战斗开始了——
日本东北地区的某座深山里，国中生小町在一间祭拜熊的神社中，担任巫女的重责大任。有一天，小町对监护人，也就是名为那津的熊说：“我想去念都市的高中。”为了能够让不经世事的小町，拥有在都市中生活的基本能力，那津展开了一连串的试炼，要求小町通过考验。
天河优人是一个非常普通的高中生。七年前父母离异，而独自一人生活。而常常受到身为青梅竹马的凛子的照顾，除此之外是个非常平凡的少年。对猫异常过敏，所以凛子如果对叫不起床的优人会将她的爱猫当作终极武器来使用，逼迫优人起床。 正当优人迎接了16岁的生日的早上，神秘的美少女“绯鞠”突然出现了。原来优人是守护人类的除妖世家“鬼斩役十二家”当中天河家的末裔，当16岁时便成为现任当家，而绯鞠正是效忠天河家的，根据优人的祖父的约定，从今之后“守护”著优人。随着优人与绯鞠不断接受退魔委托，妖怪化身的美少女角色亦逐一登场，再加上青梅竹马九崎凛子的卷入，恋爱大战随即爆发。
