纪元背景设置为世界变动率为“1.048596%”的2019年。在机器人被广泛应用的未来，种子岛中央高校 “机器人研究部”面临着被淘汰的危机，而即使在这种情况下，八汐海翔依然对“机器人研究部”感兴趣，依然热衷于机器人格斗游戏。另一个是废材部长瀬乃宮秋穂，为了避免报废，正在争取“完成巨型机器人”。然而，有一天，海翔发现了一个A.R.笔记的副本，名为“君岛报告”。在这个笔记里，有一个很大的阴谋，就是某个叫君岛安科的人会把全世界都牵扯进来。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
