从去世的祖父身上继承了不可思议力量的律，某次梦见了童年的往事。在梦中，为了躲避妖魔的觊觎，年幼的律被迫打扮成女孩子的模样，却仍差点遭到一名少女幽灵的袭击。就在不久后的某一天，律亲眼目睹那名幽灵混在母亲茶道教室的学生群中，潜入了家中。正当律试图查明对方的真面目时，却在名为「遮眼鬼」的游戏中，被夺走了左眼！？
故事发生在异世界中，在这里，被称为“噬神者”的鬼怪潜伏在人群之中，散播着恐惧和危险。在一场浩浩荡荡而又旷日持久的战争之后，人类终于以伤亡惨重为代价将噬神者们封印在了三层结界之后，然而随着时间的流逝，第一层结界碎裂了，这也就意味着，如果坐视不管的话，数百年前的悲剧将要重演。 就在这个危急关头，身形纤弱但拥有着强大力量的少女们出现了。天真乐观的静御前（铃木爱奈 配音）、温柔冷静的义经（松井惠理子 配音）、嗜酒如命的茨木童子（三森铃子 配音）、捉摸不透的辉夜（橘田泉 配音）、可爱娇小的天照（原奈津子 配音），这些少女们要对抗的，是名为“撒旦”的最强噬神者。
支配著地球上所有法則的是被成為『共存均衡』的巨大力量；『元靈神』是擁有超越人類能力並為了守護這個均衡的存在；擁有相同的外表和共同的命運的三個靈魂的『三位一體』；等待在神秘的另一端的、經歷殘酷而壯烈的戰鬥……
某日突然觉醒暗之力的女子高中生 吉田优子，为着解除施加在暗之一族身上的诅咒，为打倒魔法少女不懈努力。竟对曾经的救命恩人下手？！但是却完全没有胜算！废柴贫穷魔族与沉稳肌肉魔法少女之间的日常魔法喜剧，就此开幕！
