大雄突发奇想，想要凭借自己的力量飞上天空。他自制翅膀，在学校的后山辛苦练习，可惜屡战屡败。正在这时，一架人力飞机通过异次元空间出现在上空，飞机连同驾驶员一同栽了下来。大雄、静香和哆啦A梦救助了这个拥有翅膀的奇怪家伙，他名叫古斯基，来自鸟的国度——鸟托邦。在修好飞行器后，古斯基准备返回自己的国家，结果胖虎和小夫突然出现，阴差阳错闯入异次元空间，为了救回伙伴，大雄他们也随同前往。鸟人警备队长官滋古连度对人类极度憎恨，他企图消灭所有人类，大雄和小伙伴在鸟托邦的冒险就此展开…… 本片根据日本漫画家藤子F不二雄的长篇同名漫画改编。
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
小桃与厄卡伦踏入神秘温泉小镇，极具威胁的敌人即将现身……
