有着重度中二病的阴沉少年市川京太郎，因为很看不惯位于学校金字塔顶端的阳角美少女山田杏奈，每天都在妄想着要怎么结束掉她的性命。没想到在一次偶然情况下，京太郎撞见了杏奈不为人知的一面，爱吃零食的她常躲进京太郎的圣地图书室偷吃零食，就这样图书室变成了他们两个交集的秘密基地。随着市川的一步步观察，他发现平时以“清高、阳光”等性格示人的山田有着不为人知的一面…… 阴暗少年京太郎的初恋，萌芽了！阳角美少女×阴角男子，原本不可能缩短距离的两人，会发生奇迹吗？极甜的青涩校园爱情喜剧开始——！
故事时间为战国时代，世上具有各种魑魅魍魉、异形妖怪等等总称为「暗」的存在。喜欢人类的暗·妖狐小玉，以及厌恶人类的仙道·迅火，姊弟两人进行著扫荡罪恶的救世活动。另外还有一群专门对付暗的僧侣·断怪众，他们以不人道的方式进行人体改造，迅火等人与他们产生激烈冲突！人类当中也有坏人，非人类的存在也不见得都是邪恶的，迅火因过去的事而极其讨厌人类，但在旅程当中，也逐渐目睹到人类善良的一面，他是否能有所转变呢……
