在20世纪50年代初，突然出现的未知生命形式“甲骨文细胞”开始“捕获”地球上的一切对象。它的存在，它吞噬了一切，并取得了各种差异，作为一个凶猛的生命形式，不知不觉中，人们惊恐地称它为“阿拉加米”。现有的武器在阿拉加米之前没有任何效果，城市文明崩溃，人类逐渐被剥夺了栖息地。这种人类的光明是存在的。一种嵌入甲骨文细胞的生物武器“神机”被开发出来，并组织了特种部队，俗称“神食者”来操纵它。在一个被粗糙的神压迫的世界里，“上帝之物”的明天无战的幕布拉开。
故事发生在名为青鞜三之宫学院的学校里，这是一所校风非常严谨的学校，崇尚男卑女尊的风气，在学校里，所有的苦活累活都是男生做的，女生天生就站在食物链的顶端。不仅如此，学校里亦拒绝聘用男教师。 天和响（岸祐二 配音）是刚刚从大学毕业的热血青年，鼓足了劲想要在教育界大展拳脚。为了付清房租，天和响必须在三之宫学院找到一份工作，在房东老太太的建议之下，他决定男扮女装，潜入学校之中。最终，天和响顺利的得到了体育老师的工作，但这只是一切的开始，等待着他的，除了无尽的问题和挑战外，还有对他虎视眈眈的校长。
动画以被神秘的外星人德拉克特毁灭了几乎所有人类的地球为舞台展开。过去人类为了躲避外星人而藏身的避难所伊克西亚，毁灭之日的记忆被抹去的居民们什么都不知道地过着普通的生活。但是住民中也有一部分的“被选中的人”们，驾驶着名为罗格的巨大机器人与外星人战斗着……
