主角高町奈叶是一名普通的小学三年级女生。在去补习班的路上，她和朋友们发现了来自不同世界米德其路达（翻译米德芝尔达）的雪貂尤诺·斯克莱亚。他用心灵感应告诉奈叶，他来到这个世界的原因是为了回收他挖掘的太古遗产（平行维度中高度文明的遗产）“宝石种子”。奈叶决定取代尤诺出面回收，以保护可能因宝石种子而被破坏的城镇。没想到，这只是一系列事件的开始。他们相遇的目的和他们一样，因为回收宝石种子而出现的神秘金发女巫导师是...
不知道什么时候，整个世界被一种突如其来的未知病毒袭击，几乎被彻底毁灭。但只有13岁以下的孩子没有被病毒感染，活了下来。然而这些孩子却被从地下冒出来的吸血鬼统治着，被当做牲畜养着提供血液。故事的主人公-百夜优一郎和百夜米迦尔都是被抓的孤儿之一，但面对不堪的命运，他们没有屈服，开始计划逃跑和复仇...
