女大学生津场木葵拥有从过世的祖父那里继承来的、能看见妖怪的能力。她突然被抓到了妖怪栖息的隐世的老字号旅馆“天神屋”。感到困惑的葵得知了祖父留下的庞大欠款，以及她作为抵押必须嫁给鬼神大老板这一约定。无法接受的葵为了反抗婚事、起死回生，而向妖怪们宣言她会在天神屋工作来偿还欠款……
日本承办的全球最大体育盛事WSG即将在东京举办开幕式。 为此，融合日本先进技术打造最高时速1000km的「真空超电导磁悬浮」即将通车。往返于新名古屋站至东京新开的芝浜站。 在这个万众瞩目的关头，汇集知名赞助商的酒会现场遇到了突发事件。 知名企业的高官接连遭到绑架。事件背后，是全程监视的赤井秀一，以及等候赤井发令的FBI探员们的身影。 根据柯南的推理，本次事件也许与15年前美国波士顿发生的WSG绑架事件有关，当时也是由FBI管辖。 这真的是偶然吗？在各国游客聚集的日本到底会遇到什么样的事件？ “贯穿日本的子弹”超真空电导磁悬浮启动之时，“危险一家人”终于集结！
废材？丑女？不存在的，当所有人投以不屑与嘲讽的目光时，谁能料到，一个病怏怏的文弱少女的身体里，竟然装着一颗绝世仙尊的灵魂，胎记一除，瞬间甩什么天下第一美女一百多条街。 神器一开，别人花三四十年修炼才能达到的级别，一个时辰搞定。别人求一颗而不得的丹药，身边有个药魔自愿为她一炼一大把。白莲花心心念念的天下第一冰山男神，不好意思，已经对她一见钟情了。
美丽的数学岛上，有一个神奇的愿望之码。只要将“咔布”生产出的数字和“加减乘除”身上的符号正确填入其中，就可以实现任何愿望。博士为了实现统治世界的野心，一心想要得到五只咔布。在数学天才罗克和伙伴们的努力下，博士的阴谋最终破灭。博士跌入了愿望之门，竟然回到了过去。重回数学岛后，博士假扮成数学王子，更加疯狂地继续自己的阴谋。罗克和伙伴们齐心协力，一次次地挫败了“数学王子”的阴谋，恢复了数学岛的安宁。
