品学兼优的的医学生凌然，目标是成为云华医院最好的医生，在即将进入云华医院做实习生的时候，意外获得具有专业医学知识的金手指系统。医学系统配合刻苦努力，凌然的医术迅速得到成长，并带动身边的人一起进步，开启了充满挑战、治病救人的医者之路。天才实习生凌然能在系统的帮助下，达到怎样的医学高度呢？
在“TokyoExplosion”的未知灾难背后，有一名暗中活跃的契约者——代号“黑”，被称为黑色死神的男人。制造了与“组织”敌对的事件，黑和他的同伴，身为DOLL的银一起踏上了逃亡之路。他们一边击退组织派来的刺客，一边向南方前进。在漫无尽头孤独的逃亡旅程中，两人可以信赖依靠的，只剩下彼此而已…… 夏日的阳光下，黑和银寻得了片刻的休憩。但是，幸福的时间并未长久，深重冷酷的黑暗已悄悄迫近。本是失去自我的DOLL的银在与黑共处的日子里，渐渐开始表现出自己独立的意志。对银的变化感到困惑焦躁的黑，却并不明白这意味着怎样的事实 对于发生着变化的自己，银也非常苦恼。想和黑在一起，但是这样下去的话……以银为目标的狙击者出现，新的斗争也被点燃。命运的选择再次降临到黑的头上。几乎把两人之间的羁绊撕裂的悲剧的序幕，正悄无声息的开始上演……
故事的主角是丹羽真，一个将“青春点数”分配给自己的行为和相关事项，时而高兴时而悲伤，将被子卷在身上的少年，自称外星人的“电波女”（却是美少女）的藤和艾莉欧（藤和エリオ）。作品以这两个人为中心，展开了一个有些诡异却令人耳目一新的青春故事。
