神州浩土，万物有灵，与精灵结成伙伴的天才被称为御灵师。被封印百年的少年石大力意外遇到了来自平行世界的御灵伙伴九尾天狐青青，踏上了成为首席御灵师、寻找自己身世之谜和守护世界的道路。
大雄突发奇想，想要凭借自己的力量飞上天空。他自制翅膀，在学校的后山辛苦练习，可惜屡战屡败。正在这时，一架人力飞机通过异次元空间出现在上空，飞机连同驾驶员一同栽了下来。大雄、静香和哆啦A梦救助了这个拥有翅膀的奇怪家伙，他名叫古斯基，来自鸟的国度——鸟托邦。在修好飞行器后，古斯基准备返回自己的国家，结果胖虎和小夫突然出现，阴差阳错闯入异次元空间，为了救回伙伴，大雄他们也随同前往。鸟人警备队长官滋古连度对人类极度憎恨，他企图消灭所有人类，大雄和小伙伴在鸟托邦的冒险就此展开…… 本片根据日本漫画家藤子F不二雄的长篇同名漫画改编。
沈剑心再次回归稻香村，不断出现的奇闻、悬案、离谱发明……他和伙伴们将展开全新的冒险历程。
