故事发生在大正25年。帝都东京。 正当华族出生的久世鸫为守护没落家族决意联姻时，弟弟久世鹟却被卷入被称作“稀有之物”、会对读者产生巨大影响的书所引起的事件之中。 鸫以此为契机，能够看见被称为“灵韵”的、稀有之物所散发出的寄居者的情感，此时，“帝国图书情报资产管理局”（通称“鸱鸺”）的人出现在困惑的鸫面前。他们是保护·管理“稀有之物”的组织，并委托鸫协助调查“稀有之物”。鸫虽然犹豫，却还是决定参与“鸱鸺”，展开对“稀有之物”的调查活动—— 这是一部讲述一位命运如天秤般摇摆不定的少女的故事。
“被学妹弄哭了！”某天放学后，在偶然路过的图书室里，被超级“抖S”的学妹盯上了！欺负前辈、对前辈发难，吵闹的她的名字是——“长瀞同学”！可恨却又可爱。让人痛苦却又让人想要靠近。这是让人心中觉醒些什么的“S娇少女”的故事。
