西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。 然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。
魔法使芙莉莲和勇者辛美尔等人一起，历经十年的冒险之后击败了魔王，为世界带来了和平。身为能活上一千多年的精灵族，她于是和辛美尔等人约定再次相见后，踏上了独自一人的旅途。自那以后，50年过去，芙莉莲又前往拜访辛美尔，相比于和50年前一点没变的她来说，辛美尔已经年迈体衰，进入了风烛残年。之后，她目睹了辛美尔迎来他的死亡，痛感自己以往没能“知晓人心"，陷入后悔的芙莉莲，为了“知晓人心"，踏上了旅途。这趟旅途会邂逅各种各样的人，也有各种各样的事情在等待着她。
