1930年代，以欧洲为中心突然出现的人类之敌“涅洛伊”。 能够对抗以通常的兵器难以破坏的涅洛伊的， 只有被称作魔女的、拥有特殊魔法力的少女们而已……。 1944年9月，在以第501统合战斗航空团“Strike Witches”为中心的联合军活跃之下，高卢共和国上空的涅洛伊巢穴消灭，欧洲西部的安全得到了确保。 以此为机，联合军开始正式计划对欧洲中央—东部方面的反抗作战。 在欧拉西亚帝国彼得堡构筑了基地的， 第502统合战斗航空团“Brave Witches”也被下达了出击的命令。 背负人类的希望，充满勇气的魔女们，在东欧的寒空中巡航。
黑铁一辉虽有着成为能将灵魂转化为魔剑的≪魔导骑士≫的目标，但由于自身没有魔法方面的才能而被他人戏称为≪落第骑士≫。不过，在与来自异国的公主——有名且最强的≪A级骑士≫史黛菈・法米利昂相遇后，一辉的“最弱”的学院生活发生了改变。而另一方面，曾经的“落第骑士”重新以“无冕剑王”的身份，在这场争夺骑士顶点的战争中崭露头角！
击败青城晋级决赛的乌野，白鸟泽成为他们的下一个对手。
