故事的舞台，私立英才书院，原本是一所传统的女子高中，但由于少子化问题，不得不改制为男女同校。 作为改制后第一年入学的28名男新生之一，津田隆一不小心被拉进了学校的学生会。 在外人眼中，学生会是美女的天堂，但津田身边的三位女学生会领袖却有着非常独特的个性。
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
