爸爸是英雄，妈妈是精灵王，艾莲拥有专属于科学家的独特技能——根据自己的喜好来改变物质的结构与合成。 在爸爸、妈妈与精灵们的宠爱下，艾莲幸福成长，却在和爸爸造访人间之际被国王盯上，全家人陷入危机？ 人类和精灵200百年前的纠葛重新被提起，两族似乎永远无法重归于好…… 诅咒再一次降临人界，无数无辜人民受害。精灵艾莲决定，运用知识和力量，守护人类也守护家人。
カントー帰還！待望の新章がスタート！！ イッシュ地方からカントー地方へ戻るサトシたちが、デコロラ諸島で大冒険！ スピアーに追いかけられて、巨大クイタランに追いかけられて… えぇっ！？ミジュマルとお別れ！？ さらに！みんなオーベムになっちゃった！？さらにさらに！幻のポケモンにも遭遇！？ まさか！？アイリスとサトシが絶交！？それをニヤリと見つめるロケット団…！ 笑い！涙！お宝あり！？様々な島を巡る船旅に、いざ出発！！
目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。 十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑……
