在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
花畑佳子（悠木碧 配音）是一个实实在在的笨蛋。不仅学习力为零，常常收获零分的考卷，在生活中，也是个完全不认路，总是莫名其妙惹出各种各样麻烦的问题人物。可是，佳子虽然脑袋笨，却拥有一颗闪闪发光的善良的内心。阿久津明（杉田智和 配音）和佳子刚好相反，他拥有绝顶聪明的头脑，却不擅长一切和运动有关的事情。是他一直陪伴在佳子身边，照顾着她的学习和生活。 温柔迷糊的隅野沙耶香（原田彩枫 配音）是佳子唯一的也是最好的朋友，她的言行举止常常在不知不觉之中被佳子带歪。风纪委员长（上坂堇 配音）苦苦的暗恋着津明，佳子对于她来说，是情敌一般的存在。
乍看之下，宫本蕾贝卡（斋藤千和 配音）是一个满头金发的11岁少女，她的外表可爱个性胆小，是个人见人爱的小不点。令人想不到的是，蕾贝卡居然是毕业于麻省理工大学的天才少女，并且，她还有着一份正式的职业——桃月学院一年C班的班主任。面对着这个娇小的班主任，一年C班的同学们发出了不可置信的呼声。然而随着接触的深入，他们发现，这个外表萝莉的老师，却有着一颗正直勇敢的心。 在桃月学院里出没着各式各样有趣的家伙， C班的神秘老头子（大竹宏 配音），D班的酒鬼五十岚美幸（大原沙耶香 配音），B班的早乙女（花轮英司 配音），再加上每个班级里鬼灵精怪的同学们，蕾贝卡快乐的校园生活开始了。
