作品以总是憧憬能去使用异能力战斗的世界的高中生安藤寿为原点，没想到某天真正的超能力在他身上觉醒，于是他便有机会成为了学园异能战斗的主角。——虽然可以这么想，但生活在和平的每一天里，既没有毁灭世界的秘密机关、异能战争之类的设定，也没有勇者、魔王等角色的存在。当包括主角在内的 文艺部全员都成为了最强异能持有者，围绕着他们荒谬绝伦的超能力的故事就此上演。
ある夜、八神はやてはトラックとの事故に遭ってしまうが、「闇の書」が起動することによって助かる。そして「守護騎士（ヴォルケンリッター）」と出会い、闇の書の主となる。 ロストロギア「ジュエルシード」が発端となったプレシア・テスタロッサ事件から半年後、裁判が終わったフェイトとなのはの再会が果たされた。しかしその夜、ヴォルケンリッターの襲撃にあい敗北し、なのは達はリンカーコアを闇の書に蒐集されてしまう。 この闇の書の起動によって引き起こされる数多くの痛み・悲しみを終わらせるため、なのはとフェイトは立ち上がる。
