东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。 这日京都古寺山能寺收到奇怪书信，说若能解开信中所附的画谜，便能找到8年前被窃的如来佛像。柯南、小兰随毛利小五郎来到该寺，均对画谜一筹莫展。5名被杀者之一曾对与新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加，服部也来到京都对案件秘密展开调查，并借机找寻自己的初恋情人。柯南与服部相遇联手调查时，发现有人想置服部于死地，紧接“源氏萤”另一成员被害，而这一切，似乎又都与画谜有关。
开局一座山寨，两个人口（军师，马夫），将要打造最强山寨。他穿越到乱世，拥有一座马上要散伙的山寨。面对这杀戮乱世，是打算抢钱抢粮抢婆娘做一个逍遥山大王，还是泼出这身男儿血，交锋世上英雄，搏一个名震古今，问一声：王侯将相，宁有种乎！
在初音岛上，樱花一年四季都在盛开，而我们的故事就发生在这个浪漫的地方。朝仓纯一（泰勇气 配音）是就读于风见学园的高中生，和别人不同的是，他拥有能够看见别人梦境的神奇能力。这一次，他又梦见了那个不知名的女孩，她的音容笑貌是如此的熟悉，可纯一就是记不起她的名字。这天，学 校新来了转学生芳乃樱（田村由香里 配音），令纯一吃惊的是，她竟然就是自己梦中的女孩。原来，樱是纯一幼时的玩伴，两人曾经许下了秘密的约定。 朝仓音梦（野川樱 配音）对没有血缘关系的哥哥纯一一直有着格外的好感，对于半路杀出的樱，音梦感到很不是滋味，而纯一对樱的热情奔放也深感头痛。在这个樱花盛开的小岛上，在三人之间，会连结出怎样的情感羁绊呢？
上古神兽貔貅皮皮来到了人间，为了躲避人类追捕，逃到了好友四不像开的专门帮助神兽的鹿人店，并结识了一群来自四面八方，性格各异的神兽，开始了远离人烟，轻松惬意的日常。
