居住在意大利那不勒斯的青年乔鲁诺·乔巴拿，是继承了乔斯达家宿敌·DIO之血脉的儿子。 幼年时遭受迫害而自暴自弃的他，由于拯救了一名黑帮男子，而学到了“相信他人”。不忘恩义、带着敬意对待自己的黑帮，让他的心变得率直。就这样，乔鲁诺开始对“黑帮明星”怀有憧憬。 15岁的乔鲁诺，与统领意大利黑社会的黑帮组织“热情”一同引发事端，并成为被盯上的目标……
曾从日本来访，给世界带来巨大灾害的“迷途之人”。因为他们过去带来了毁灭世界的灾难，所以被视为“禁忌指定”，有必要暗中处刑。以处刑“迷途之人”为业的“处刑人”梅诺，有一天遇到了日本少女灯里。梅诺像往常一样打算完成任务，但因为灯里的“某种能力”而以失败告终。为了确实地处刑灯里，梅诺带着她，向着能够消灭任何异世界人的仪式场地的大教堂进发。看着对这场自己即将被杀的旅行一无所知，而单纯地享受着的灯里的样子，梅诺心中有什么地方开始改变了。——这是，她为了杀她的故事。
支配著地球上所有法則的是被成為『共存均衡』的巨大力量；『元靈神』是擁有超越人類能力並為了守護這個均衡的存在；擁有相同的外表和共同的命運的三個靈魂的『三位一體』；等待在神秘的另一端的、經歷殘酷而壯烈的戰鬥……
