東京西部に位置する巨大な『学園都市』。 総人口230万人を数え、その約８割を学生が占めるこの都市では、超能力開発のための特殊なカリキュラムが実施され、学生たちの能力は『無能力レベル０』から『超能力レベル５』までの六段階で評価されていた。 そんな学園都市で、能力者たちの頂点に君臨する最強の能力者・アクセラレータ。 ７人しかいない『超能力者』の中でも、飛び抜けた能力を誇る第一位は、その力ゆえに殺伐とした日常を送っていた。繰り返される常軌を逸した『実験』と、絶対的な力を求めた末に経験した敗北。その先に待っていた、とある少女――ラストオーダーとの出会いによって、運命が大きく変わることになる。 最強にして最凶の『悪』 ――アクセラレータが、 学園都市の『闇』をなぎ払う!!
在艾倫他們居住的帕拉迪島之外，還存在一個其他人類居住的世界。當中一個國家「瑪雷」與其他各國爆發戰爭。陷入苦戰之際，他們決定要攻進帕拉迪島，把「始祖的巨人」搶過來。在這裏又看到另一羣孩子們拼命求生存的身影……。
在20世纪50年代初，突然出现的未知生命形式“甲骨文细胞”开始“捕获”地球上的一切对象。它的存在，它吞噬了一切，并取得了各种差异，作为一个凶猛的生命形式，不知不觉中，人们惊恐地称它为“阿拉加米”。现有的武器在阿拉加米之前没有任何效果，城市文明崩溃，人类逐渐被剥夺了栖息地。这种人类的光明是存在的。一种嵌入甲骨文细胞的生物武器“神机”被开发出来，并组织了特种部队，俗称“神食者”来操纵它。在一个被粗糙的神压迫的世界里，“上帝之物”的明天无战的幕布拉开。
