“天使之卵”架构在一个充满阴影和灰暗色彩的超现实主义世界中，剧情的主角是两个没有提及名字的少年与少女。 少女随身带着一颗神秘的蛋，她花许多的时间在某个歌德式的死城里搜集各式瓶子与手工艺品。身上背着一把十字型武器的少年在某天也随着一种神秘的机械来到这个城镇。 同时，巨大腔棘鱼的身影在城镇上方出现，城市里的人也成群的活过来开始用长枪猎捕这些鱼群。 在少女如巨穴般的瓶子中，就像个庇护所一般，里面收藏着蒐藏品。少年等少女入睡后将那颗神秘的蛋打破。 少女表现得很生气并紧跟着已经离开的少年。最后少女沉入了溪谷中死去，她口中吐出来的气泡最后都化作了一颗颗的蛋。
故事以一連串女高中生離奇死亡的事件開始，深陽學園2年C組的女學生宮下藤花原來隱藏著「Boogiepop Phantom」的第二重人格，行為奇異，究竟宮下是否這些死亡事件的主谋？ 「Boogiepop Phantom」到底是都市中傳說的死神，還是正義的使者？
疯狂科学家里克桑切斯在失踪 20 年后突然回到了女儿贝丝的生活中，并在她的车库里开了一家商店。 更糟糕的是，瑞克总是把他的孙子莫蒂和孙女萨默“拖”到他的疯狂实验中。 每次他发明一个科幻小玩意儿，莫蒂都会以他独特的方式给家里添乱。 两人总是处于不同的困境中，有着荒谬的结局和编剧巧妙的情节安排。 每次看一集，总能让人鼓掌。 剧情内容充满了精彩的科幻素材。 各个平行世界的祖孙爆发事件看似荒谬可笑，实则充满了对人性和社会的思考。
