堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。 园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。 然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。
内心情感难以自控的黑沼爽子勇敢地向风早翔太表白了自己的感情，而风早也以真诚的表白回应了她。二人开始恋爱关系，从第一次约会到学生恋爱的日常生活，在年轻爱情的喜悦和尴尬中航行。在最初的尴尬中，他们的爱情故事逐渐展开，同时他们与朋友们的关系也蓬勃发展。这个关于爱情和友谊的苦乐参半的故事探索了青少年情感的复杂性，每个角色都学会了理解自己对爱情的独特感受。
