男主坂町金次郎是私立兰加兰学园的普通二年级学生。 他有一种很特殊的体质，那就是女性恐惧症——只要皮肤接触到女性，就会产生排斥反应，引起抽搐。 , 严重时会流鼻血窒息而死。 他的名字在标题中还含有“胆怯、怯懦”的元素。
女主角近江昴，是坂町金次郎同学的同学坂月樱的管家。 因为小时候的一次意外，她患上了“刀具恐惧症”。 虽然是女人，但她伪装成男人，当起了管家。 身着男装陪大小姐上学。 然而，良月一家之主却向她提出要求，“三年内，只要有人查出她是女孩子的身份，她就立即开除管家的工作”。 结果，她还是被男主戏剧性的发现了。 她的秘密。
坂町金次郎能保守这个秘密吗？ 从此，他不得不和龙月、近江昴讲述的故事开始了！
柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙将凶手追踪，但凶手逃脱。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味这两起杀人事件与警察内部人士有关。 柯南、小兰等人参加白鸟妹妹的婚宴，电突然间停掉，那刻小兰正与女警佐藤在洗手间。小兰拿起身边的手电筒欲照明时，一颗子弹射进佐藤身体，小兰吓昏过去。次日小兰醒来，却因怪责自己害佐藤挨枪失去记忆。目暮见事态越来越严重，将秘密说出，原来死去的两名警察正与佐藤一起重查一桩有关医生仁野自杀的案件，该案涉及到警察局长的公子。将局长公子假定为嫌疑人之...
