“双向的单恋”令人好心焦。佐城涉暗恋同班的美少女夏川爱华。他满怀美梦，希望与她两情相悦而积极地展开追求，即使遭受挫折也不气馁。但是，就在某一天，他的梦突然醒了。“条件那么好的女生……我根本高攀不起吧？”理解了现实之后，涉开始与爱华保持适当的距离。而这样的态度反而令爱华茫然。“莫非……他讨厌我了？”误会让爱华不知所措，开始表现出连自己都没察觉的好感……？！双向单恋的两人之间彼此误会、令人心痒难耐的青春恋爱喜剧，开幕！
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
