吉冈双叶从国中时期就很不擅长和男生相处，却有一位名为“田中”的男生例外，然而田中在暑假转学了，双叶也来不及传达自己的心意。之后，在男生群非常受欢迎的双叶遭受女生的排挤，在升上高中后的双叶为了不再让女生讨厌决定要伪装自己，同时她与国中时代的初恋“田中”再次相遇了……
职于新宿区政府的宫古新，本应成为一个普通的公务员，却被调遣到了一个东京23区各区都无人知晓的“夜间地区交流科”工作。 工作的内容是，解决各种妖怪们引起的超自然事件。 与部门的前辈即课长榊京一，和狂热爱好超自然现象的姬冢圣央一起，每日与超越人类常识的存在相处，日日夜夜出勤工作。
