堂本一辉是著名的钢琴演奏家，两年前突然宣布不再演奏钢琴转而攻向管风琴，更斥资建造了堂本音乐厅，准备在落成之日举行演奏会。然而在演奏会之前，堂本音乐学院的学生相继死去，先是爆炸案，后是单个被杀。 园子带着柯南一行人来听排练，认识了女高音歌唱家秋庭怜子，拥有绝对音感的秋庭也开始遭遇到危险：润生茶被下药、作森林浴时遭遇空气枪袭击、试演会当天更遭击晕。 然而就是从这些事件中，柯南找到了推理的逻辑：凶手试图把秋庭排除在凶杀外。这边已经正式开演的演奏会浑然不知音乐大厅外已是爆炸连天，小兰、灰原哀以及演奏厅内的一千多人顿时危在旦夕，绝对音感成为了唯一的救命线索。柯南找到了爆炸的逻辑，要在罪犯引爆最后一个炸弹前，把他找出来。
北原伊织升入大学后，开始寄住在伊豆的叔父所经营的潜水用具店“Grand Blue”。传入耳中的波涛声、炽烈照射的太阳、开始一起生活的可爱表姐妹……青春的大学生活！这样的伊织所面临的却是——除了野球拳以外的猜拳一概不知的强壮男人们！！刚一入学就被大学潜水社团“Peek a Boo”所盯上了的伊织，在会长时·田信治和三年级学生·寿龙次郎的怂恿下，不知不觉已经身为社团的一员加入了他们的愚蠢喧嚣中。在大学中认识的虽然长得帅但性格却很遗憾的宅男——今村耕平也加入其中，他们的青春向着越来越奇怪的方向转进。明明在寄住的地方有着可爱的表姐妹——古手川姐妹，但自己却被妹妹千纱当成垃圾看待，而姐姐奈奈华又是重度妹控，根本无法成为对象。在可爱的全裸笨蛋们的包围之下，伊织的大学生活究竟会变得如何……。
