咖啡馆·黑猫亭。那是在皇都五区的角落里，孤零零的一家咖啡店。在那里工作的是集结了技术精华的自律式机械人偶少女们。几年前刚刚结束的大战争。在那里作为武器制作的她们。不久迎来了战后的和平。和新品一样被修复，穿着闪闪发光的和服寻找新的任务，高声歌唱。你也和她们一起度过美好的时光吧！
不知道什么时候，整个世界被一种突如其来的未知病毒袭击，几乎被彻底毁灭。但只有13岁以下的孩子没有被病毒感染，活了下来。然而这些孩子却被从地下冒出来的吸血鬼统治着，被当做牲畜养着提供血液。故事的主人公-百夜优一郎和百夜米迦尔都是被抓的孤儿之一，但面对不堪的命运，他们没有屈服，开始计划逃跑和复仇...
故事发生在巡之丘学园中，丈枪由纪（水濑祈 配音）天真可爱，是名副其实的开心果。惠飞须泽胡桃（小泽亚李 配音）踏实可靠，她的坚强和元气影响了身边的每一个人。若狭悠里（市道真央 配音）温柔坚强，是大家心目中稳重的靠山。直树美纪（高桥李依 配音）外表冷漠，但内心的热情不容忽视。这些可爱的孩子们共同组成了“学园生活部”，每天都在进行愉快的部活。 空无一人的校园，破败不堪的教室，四处游走的行尸，究竟哪一个是幻想，哪一个是真实？巨大的灾难面前，少女们将恐惧化作力量，尽各自的所能，目的只有一个，那就是活得更久，更快乐。
