职于新宿区政府的宫古新，本应成为一个普通的公务员，却被调遣到了一个东京23区各区都无人知晓的“夜间地区交流科”工作。 工作的内容是，解决各种妖怪们引起的超自然事件。 与部门的前辈即课长榊京一，和狂热爱好超自然现象的姬冢圣央一起，每日与超越人类常识的存在相处，日日夜夜出勤工作。
不明白与人恋爱的心情，为此感到烦恼的小糸侑，在初中毕业时被要好的男生告白，却无法给予回应。她在此时邂逅的学生会成员七海灯子，不论被谁告白，都无法喜欢上对方。与灯子感到共鸣的侑，将自己的烦恼坦诚相告，却反而从灯子那里听到了意想不到的话语——“我好像会喜欢上你。”
