爱德华德和他的弟弟阿尔芬斯十分思念在他们还小的时候亡故的母亲，实行了炼金术中最大的禁忌——可以将死者复活的人体炼成。 可是炼成失败，爱德华德失去了左腿，阿尔芬斯则失去了全身。爱德华德好不容易才以牺牲自己的右臂为代价将弟弟的灵魂炼成，并定着在一副铠甲上，可是其代价未免太大了。爱德华德和阿尔芬斯一起，为了找回所失去的一切，开始踏上了寻找拥有极大力量的“贤者之石”的旅程。 右臂和左腿用钢制义肢“机械铠”来替代的他，被人们称为“钢之炼金术师”…
一所位于东京都千代田区的传统高校“音乃木坂学院”，因为入读的学生人数骤减，所以正面临着废校的危机。其中有三名少女想到一条妙计——成为偶像，只要她们成为偶像，学校的名气便会增加，而入读学生的人数亦会上升。就这样，九位个性鲜明的少女决定一起努力成为偶像，希望可以凭借偶像的名气增加生源来挽救自己所喜爱的校园。
柴木耕太（高桥信 配音）是一位非常平凡的男子高中生，性格木讷的他向来就没有什么女生缘，一直过着形单影只的生活。一次偶然中，耕太得到了一本魔导书，通过这本魔导书，耕太召唤出了名为璐璐萌（三森铃子 配音）的魔女。璐璐萌是一个可以实现别人愿望的魔女，但是对方必须付出生命作为交换，可是，因为违反了魔界的规定，璐璐萌被开除了魔籍，不仅契约失效，而且无家可归。 善良的耕太收留了璐璐萌，就这样两个人开始了吵吵闹闹的同居生活，和他们一起的，还有璐璐萌的黑猫使魔奇洛（福圆美里 配音）。热热闹闹的每一天拉开了序幕。
