主人公·秋山奏隶属于学校的天文学会，而天文学会当中有着许多个性丰富的成员。他们在一起解决发生在内滨学园的各种怪异事件。而他之所以加入天文学会，也有着一段不为人知的故事：某天因为受伤的关系，他放学后不得不继续留在学校的保健室当中，这时他却听到教学楼方向传来奇怪的声音。而当他急忙赶到现场后，居然发现一名全裸的少女倒在地上！这个名叫古川唯的少女虽然没有明确表露身份，但似乎早就认识秋山奏的样子。第二天秋山奏就加入了天文学会，然后受到学生会的委托，开始与天文学会的成员一起调查学校周围发生的“校内幽灵事件”、“睡眠病”、“事故频发地区”等灵异事件……
天才少年古云，因为被上古神族中下神印，导致灵力减弱，成为青山门公认的废物，被贬为杂役。父亲因此被牵连，废除族长之位，囚禁在敌人飞卢家族的天牢里。这时古云发现了自己身上隐藏的秘密，并且跟古神达成合作协议。
现代少年莫梵，在一次偶然事故后，变成天赋灵纹被夺的莫家嫡系少爷莫梵。在”金手指消息早知道“（早大人）的帮助下，莫梵恢复了天赋，并从早大人提供的信息中，得知青玄王宝藏的消息，同时也提前预知了爷爷数日后就会走火入魔的消息。为得到青玄王留下的传承来救爷爷，莫凡向青玄王的残魂立下心魔大誓……
在恐龙世纪，一颗陨石碰撞地球，造成一场大爆炸，这场大爆炸形成了一个裂缝空间，此空间就是斗龙世界。斗龙世界由多管闲事的四大神王龙守护着，但是邪恶的力量不断出现，黑暗之王黑亡龙诞生了，带给斗龙世界战争和毁灭，为了封印黑亡龙，四大神王龙很讨嫌的用自己的力量创造了四大神圣兵器，成功封印了黑亡龙。 有光明的地方就有黑暗，黑亡龙的势力还是不断在扩展，影响了整个斗龙世界，随着时间的推移，黑亡龙即将复活，并把黑暗势力推向地球。 世界各地涌现一股虚拟游戏的热潮，恐龙主宰地球长达数亿年之久。可怕的事情终究发生了，全世界十万个孩子与青少年突然消失，共同的特征就是他们都非常喜欢这款游戏。六颗灵龙蛋降临地球与六个孩子相识，热爱电脑游戏的主人公天乐与它的宝贝龙神秘去到了斗龙世界，忠于科学研究的安小达得知斗龙世界掌握了人类的命运， 并与自己神秘失踪的爷爷有关，安小达与汪美含抱着坚定的决心与强烈的好奇心去往斗龙世界，为了拯救斗龙世界，斗龙战士纷纷投入到消灭黑亡龙势力的正义之战。安小达、天乐、汪美含、欧阳
