主角高町奈叶是一名普通的小学三年级女生。在去补习班的路上，她和朋友们发现了来自不同世界米德其路达（翻译米德芝尔达）的雪貂尤诺·斯克莱亚。他用心灵感应告诉奈叶，他来到这个世界的原因是为了回收他挖掘的太古遗产（平行维度中高度文明的遗产）“宝石种子”。奈叶决定取代尤诺出面回收，以保护可能因宝石种子而被破坏的城镇。没想到，这只是一系列事件的开始。他们相遇的目的和他们一样，因为回收宝石种子而出现的神秘金发女巫导师是...
