在与暗之科学王国的战斗之后，千空一行人以让史丹利等人占领珀耳修斯号为代价，成功捕获了杰诺。为了躲避猛烈追击，千空一行人以石化光线发源地南美为目标启程！ 千空与杰诺决定短暂联手，结合彼此的知识，共同逼近那令人憎恶的「光」的真相！ 为了拯救人类的未来，千空将与伙伴们携手，全力开拓属于他们的「科学之道」！！
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不明白与人恋爱的心情，为此感到烦恼的小糸侑，在初中毕业时被要好的男生告白，却无法给予回应。她在此时邂逅的学生会成员七海灯子，不论被谁告白，都无法喜欢上对方。与灯子感到共鸣的侑，将自己的烦恼坦诚相告，却反而从灯子那里听到了意想不到的话语——“我好像会喜欢上你。”
